在《星際迷航：下層艦員》第四季中，一股神秘未知的毀滅性力量突然席卷星際艦隊系統(tǒng)，多艘星艦接連被摧毀并威脅銀河系安全。塞里托斯號因長期執(zhí)行邊緣化任務(wù)而意外避開此次災難，但水手號、博伊姆勒號、滕迪號、盧瑟福號及臨時特林號的船員們被迫直面危機：他們既要對抗試圖接管艦體控制系統(tǒng)的惡意人工智能，又因空間異常現(xiàn)象被困于多維洞穴網(wǎng)絡(luò)。在執(zhí)行星際艦隊常規(guī)任務(wù)的過程中，各艦船員遭遇了包括經(jīng)典角色在內(nèi)的新老外星種族——既有此前系列中曾引發(fā)重大沖突的文明勢力，也出現(xiàn)了可能改變星際聯(lián)邦戰(zhàn)略格局的未知智慧生命體。這些原本被視為基層的艦員們不得不在系統(tǒng)性危機中尋找生存之道，同時揭露威脅銀河系穩(wěn)定的核心真相。