白蓮教徒在滿清大臣納蘭元述（甄子丹）指使下，以“扶清滅洋”為名在廣州街頭暴力襲擊洋人機(jī)構(gòu)及無(wú)辜平民，其暴行激怒黃飛鴻（李連杰）、十三姨（關(guān)之琳）與梁寬（莫少聰）。醫(yī)學(xué)會(huì)議上，黃飛鴻結(jié)識(shí)革命黨領(lǐng)袖孫文（張鐵林），認(rèn)同其救國(guó)主張后決意協(xié)助革命黨脫險(xiǎn)。黃飛鴻率眾突襲白蓮教總壇，擊敗九宮真人并戳破其裝神弄鬼的騙局。目睹國(guó)家積弱民眾愚昧，黃飛鴻憤而與納蘭元述展開(kāi)生死對(duì)決，在最終決戰(zhàn)中將其擊斃，革命黨人得以繼續(xù)推進(jìn)救國(guó)事業(yè)。