故事發(fā)生在神世紀(jì)300年，結(jié)城友奈作為初中二年級學(xué)生，日常與同伴在勇者部進(jìn)行社團(tuán)活動。以部長犬吠埼風(fēng)為核心，成員們通過特殊契約獲得召喚精靈的力量，肩負(fù)著對抗神秘敵人Vertex的使命。這些來自異界的威脅持續(xù)侵襲人類世界，勇者部成員們運(yùn)用戰(zhàn)斗系統(tǒng)"Vertex Breaker"進(jìn)行針對性打擊。隨著調(diào)查深入，眾人逐漸發(fā)現(xiàn)Vertex的出現(xiàn)與神樹系統(tǒng)存在關(guān)聯(lián)，而持續(xù)戰(zhàn)斗正對她們的身體產(chǎn)生不可逆影響。在維持校園生活與執(zhí)行特殊任務(wù)的雙重壓力下，友奈和同伴們既要面對現(xiàn)實(shí)創(chuàng)傷，又需解開隱藏在歷史文檔中的真相。某次遭遇戰(zhàn)中發(fā)現(xiàn)的古代終端，意外揭示出過往勇者部隊(duì)存檔數(shù)據(jù)，暗示著這場持續(xù)三百年的戰(zhàn)斗背后另有隱情。當(dāng)新出現(xiàn)的Vertex展現(xiàn)出超越認(rèn)知的特性時，勇納奈等人必須在守護(hù)日常與突破禁忌之間做出抉擇。