地球航天基地捕捉到一組神秘信號后，艦長原駕駛星際飛船深空號攜93名船員及智能機器人"柒"啟程探索外星文明。飛船失蹤150年后突然出現在地球軌道，唯一幸存者是艦長戀人尹。調查揭示深空號在探索信號源時遭遇未知外星生命體，該生物通過同化宿主實現種族延續。船員相繼被感染變異成新型生命形態，艦長原為阻止災難擴散啟動飛船自毀程序時意外觸發時空畸變。尹因特殊基因未被完全同化，在飛船核心艙休眠中維持人形，其血液樣本成為解開外星生命遺傳密碼的關鍵。委員會通過解析尹的記憶數據發現，所謂神秘信號實為該外星種族向宇宙播撒的生存種子。