柯克船長(zhǎng)（克里斯·派恩飾）與企業(yè)號(hào)船員進(jìn)入銀河系未知區(qū)域執(zhí)行五年探索任務(wù)期間，遭遇由克羅納（伊德瑞斯·艾爾巴飾）領(lǐng)導(dǎo)的敵對(duì)勢(shì)力襲擊。飛船墜毀于阿爾塔6號(hào)荒漠星球后，船員們被迫分散逃生并遭受當(dāng)?shù)胤N族蜂群式追殺。柯克與契訶夫（安東·葉利欽飾）在尋找逃生設(shè)備途中偶遇外星戰(zhàn)士杰拉（索菲亞·波多拉飾），后者揭露克羅納為獲取星際聯(lián)邦秘密武器而利用蜂群種族建立軍事基地的陰謀。斯波克（扎克瑞·昆圖飾）與麥考伊（卡爾·厄本飾）帶領(lǐng)幸存船員修復(fù)企業(yè)號(hào)殘骸期間，與克羅納展開(kāi)飛船控制權(quán)爭(zhēng)奪戰(zhàn)。最終團(tuán)隊(duì)通過(guò)杰拉提供的基地坐標(biāo)實(shí)施反制，利用超空間跳躍裝置突破蜂群圍剿并摧毀克羅納的戰(zhàn)艦，全體成員重新集結(jié)后繼續(xù)向未知星域進(jìn)發(fā)。