位于東京的東都線地鐵開通當日，一起針對東京都知事朝倉優一郎的炸彈襲擊事件爆發，導致東都線列車損毀。經過一番推理，柯南（高山みなみ配音）等人認定這與8年前朝倉主持負責的北之澤水壩修建有關。當年為了修建大壩，朝倉動員北之澤村的人民搬入新村，仍有部分村民反抗搬遷。為探明真相，柯南、灰原（林原めぐみ配音）、少年偵探團以及毛利小五郎（小山力也配音）等人前往北之澤調查。在這片雪國環境中，少年們發現原住村民山尾溪介、遠野瑞希及立原冬美等人表面和睦卻存在隱秘矛盾。隨著調查深入，柯南發現現任村長女兒山尾玲子（因父親曾遭朝倉陷害致死）為報復而策劃襲擊，并利用水壩融雪裝置制造定時爆炸以引發大規模雪崩。最終柯南識破其計劃，在灰原與少年偵探團配合下成功拆除炸彈，揭露朝倉為掩蓋當年強拆丑聞而隱瞞水壩安全隱患的真相。影片結尾北之澤村民與當局達成和解，朝倉因瀆職罪名被依法處理。本片為《名偵探柯南》第15部劇場版，強調環境問題與人性救贖主題。